施用有机肥，土壤固氮菌比对照增加近一倍，纤维分解菌增加近2倍，其它微生物群落也有明显增加，所以施有机肥能大大促进新开垦土地的熟化进程。

施用有机肥能改善土壤团粒结构，增强土壤透气性和保水保肥蓄热能力，使土壤疏松肥沃，缓解土壤盐渍化，促进蔬菜根系发育，提高其抗病抗灾能力。

有机肥发酵设备各种型号齐全，可知足多层次有机肥，蘑菇种植等出产商的需求。适合污泥成肥和微生物发酵畜禽粪便的工艺要求，能有效地把污泥、粘稠鸡粪等物料与菌种、秸秆粉拌匀。为物料发酵创造了更好的好氧环境。

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而不经有机肥生产线处理或简单的用传统单一方法处理所制成的有机肥，往往会因有害气体会损害农作物种子的发芽生根，因不能分解粪便中的有害物质，施入土壤中也不能完全活化因使用化肥蓄积的有害成分，从而大大的降低了有机肥的功效，而且还会发出恶臭味，污染环境。